昆仑河源考
(清)万斯同撰。万斯同(1638—1702年)，字季野，学者称其为石园先生，鄞县(今浙江宁波)人，曾以布衣身份参编《明史》，另著有《历代史表》、《纪元汇考》、《庙制图考》、《石经考》、《历代宰辅考》、《石园文集》等多种。本书共一卷。作者以为元笃什言《河源昆仑》与《史记》、《汉书》不合，《水经》所载亦有谬误，故而历引《禹贡》、《禹本纪》、《尔雅》、《淮南子》及各史之文以考证之。旧说如张骞言河源出盐泽、司马迁言河源出于阗等。后来诸书，都无异说。《唐书·吐谷浑传》，始有李靖望积石山览观河源之言，而亦未确有所指。潘昂霄等以鄂敦塔拉之潜行复见者，指为河源，以阿木尼玛勒占木逊山即古积石山，指为昆仑，《元史》将其观点采入《地理志》中。万斯同对上述旧说一一考辨，得出河有两源之说。今天看来，万氏之言也并不确切，但所引史料颇多，可验证古人之河源观。《昆仑河源考》有浙江鲍士恭家藏本。今收入《中国西北文献丛书续编·史地类》，见第九册。
庙制图考
《庙制图考》是书统会经史,折衷庙制,上溯秦、汉,下迄元、明,凡历代庙制沿革,悉为之图,以附于经图之后而缀以说。四库馆臣称其“用功颇勤”,“义例亦颇明晰”,“援证精确”,多“为前人所未发矣”。是书,《浙江书录》、《鄞县通志》、王渔洋《香祖笔记》、刘坊《万季野先生行状》、《清史列传》等均著录为四卷,惟《四库全书总目》著录为一卷,四库馆臣疑为传抄者所合并。该书主要传本有清传是楼刻本、辨志堂刻本、《四库全书》本、清无名氏抄本、《四明丛书》本、民国庐江刘氏远碧楼抄本等。
儒林宗派
十六卷。清万斯同撰。本书记孔子以下迄于明末儒家各派授受源流，各以时代为序，其上无师承后无弟子者，则列入附录。所列仅及人名、字号、师承与弟子，间有籍贯，而无事迹。自朱熹《伊洛渊源录》出后，《宋史》遂以道学儒林分为两传，门户分明，水火相争。明以来谈道统者，扬己凌人，互相排轧，终酿门户之祸。万斯同目击其弊，因著此书，期以消除朋党。凡自汉至唐传经之儒，一一具列，持论甚为公允，较之《学统》、《学案》诸书，可谓翦除固习，无门户之见。有《四库全书》本，《四明丛书》第三集又有清王梓材增注本。
庚申君遗事
顺帝名妥欢帖睦尔，明宗之长子。母罕禄鲁氏，名迈来迪，郡王阿儿厮兰之裔孙也。初，太祖取西北诸国，阿儿厮兰率其众来降，乃封为郡王，俾领其部族。及明宗北狩，过其地，纳罕禄鲁氏。延祐七年四月丙寅，生帝于北方，当泰定帝之崩，太师燕铁木儿与诸王大臣迎立文宗，文宗既即位，以明宗嫡长，复遣使迎立之。明宗即位于和宁之北，而立文宗为皇太子，及明宗崩，文宗复正大位。
资治通鉴后编
一百八十四卷。徐乾学主编，万斯同、 阎若璩、 胡渭等编纂。 体例仿 《资治通鉴》， 关于史实之详略先后， 作考异以折衷; 诸家议论可取者， 附录于各条之下; 断以己意则标“乾学曰” 以别之。 全书起自960年 (宋太祖建隆元年)， 止于1367年 (元顺帝至正二十七年)， 史料丰富， 尤精于舆地， 校勘补遗， 用力颇深。
南疆逸史
五十六卷。清温睿临撰。温睿临，字邻冀，一字令贻，号哂园，浙江乌程(今吴兴)辑里人，康熙己酉科(1705)举人。他博赅群书，谙熟历史，与万斯同(季野)交谊甚厚，在清廷开明史局时，温氏也正在北京，而万斯同实主其事，其间两人时相往复，多所讨论。就在万斯同的鼓励下，温氏撰写了这部反映南明三朝事迹的记传体史书。他在该书的凡例中说，记载南明史事的书籍，所见者有四十余种，“其间记载有详略，年月有先后，是非有异同，毁誉有彼此。取万子季野明末诸传及徐阁学《明季忠烈纪实》诸传，合而订之，正其讹缪，删其繁芜，补其所缺，撰其未备，以成是编”，因此，该书史料价值较高。此书在清代主要以钞本流传 (分为二十卷本和四十卷本)，民国四年(1915)上海国光书局铅印了四十卷本，另外还有一个五十六卷本，中华书局在1959年铅印者即为此本。此本在内容上要比四十卷本多，为目前较为完备的版本。
读礼通考
一百二十卷，清徐乾学著。此书积十余年，三易其稿。始撰于康熙十六年(1677)。二十九年续加订定。得阎若璩、万斯同、胡渭等协助,三易其稿而成。著者去世二年后,于康熙三十五年刊行。于《仪记》的《丧服》、《士丧》、《既夕》、《士虞》等篇及《大戴礼》、《小戴礼》，兼取众说，剖析其义。于历代典制，则一本正史，参以《通典》及《开元礼》、《政和礼》、《新仪》诸书。全书立八大纲：(1)丧期;(2)丧服;(3)丧仪节;(4)葬考;(5)丧具;(6)变礼;(7)丧制;(8)庙制。《丧期》各代有异同的，则列表以明之;《丧服》、《丧仪节》、《丧具》则有图，缕析条分，颇为详备。其书博而有要，超迈前儒， 自古以来言丧礼最完备之书。其后秦惠田《五礼通考》，即因其义例而成之。
广阳杂记选
本书（一册八二面四九、二○○字）以选自刘献廷「广阳杂记」九十馀则为主，而另选王士禛「池北偶谈」十则、「香祖笔记」六则、钮琇「觚賸」十六则及题花村看行侍者「谈往」一则为附。要之，係就上述清初各种笔记中选集有关明季及清初台湾若干遗事。「广阳杂记」作者刘献廷，字继庄，一字君贤，用号广阳子；顺天大兴人。生于清顺治五年，以布衣游名公间。博览，负大志；万斯同尤心折之，引参明史馆事。所著「广阳杂记」中关于南明与郑氏若干遗事，每多得自口碑。今选录者，如「郑克塽奏缴册印」、「赐姓与杨于两」、「林兴珠阿克萨之捷」、「洪复」、「小国姓」、「鲁世子垦田」、「黄梧平海五策」、「黄性震」等各则，史料价值极高。「池北偶谈」与「香祖笔记」作者王士禛，字子真，一字贻上，号阮亭，别号渔洋山人；山东新城人。清顺治十二年，成进士。由扬州推官，累官至刑部尚书。所选上述两笔记中关台事者，均属清代早期文献。「觚賸」作者钮琇，字玉樵；江苏吴县人，贡生。康熙时，知高明县。所著「觚賸」记明末清初杂事，多可补正史之阙。选录十馀则，尽为南明及台湾掌故。「谈往」（旧题「花村看行侍者偶录」）作者花村看行侍者，不知何许人；据「四库全书」存目：『盖明之遗民遁迹为僧者也』。所记凡二十七则，选录「飞黄始末」一则係述郑芝龙事。
白话明史
《明史》，记传体断代史书。“二十四史”之一。清朝顺治二年(1645)曾敕修《明史》,未成而罢。康熙十八年(1679)再开史馆,徐元文、徐乾学、王鸿绪先后任总纂,聘万斯同审定。成书三百十卷,即今署名王鸿绪之《明史稿》。此书为《明史》白话文。
石经考异
二卷，清杭世骏著。此书有见于顾炎武《石经考》采摭未备，辨正未明，而纠讹补缺所著。上卷标十五目：①延熹石经;②书碑姓氏;③书丹不止蔡邕;④三字一字;⑤正始石经非邯郸淳书;⑥魏文帝《典论》;⑦汉魏碑目;⑧《隋书、经籍志》正误;⑨鸿都学非太学;⑩魏太武无刻石经事;(11)顾考脱落北齐二条;(12)《唐书·艺文志》载“石经”与《隋志》不同;(13)唐石台《孝经》;(14)唐石经;(15)张参《五经文字》。下卷标目为三：①蜀石经;②宋开封石经;③宋高宗御书石经。书前列有厉鹗、全祖望、符元嘉三人的序，对其书多高度评价;又引何休《公羊传注》证汉石经为一字石经;引孔颖达《左传疏》称魏石经为三字石经;引《魏略》、《隋志》、《晋书》证邯郸淳有功于石经;引《魏书·崔浩传》和《高允传》证魏太武时未尝无立经事，与杭世骏书相发明。但书中亦偶有疏漏，可与顾炎武、万斯同之书相参证。今存《四库全书》。